lncRNA的研究方法有哪些？

lncRNA的研究方法有哪些？

研究方法很多，看360问答你出于什么实验目的，如果从零开始，可以按照这篇文章的技术路线进行设计实验：

lncRNA研究策略

转载理领快通理重别鲜标区请注明来自丁香园

发布日期：2012-09-2114:47文章来源：丁香园

分享到：收藏夹新浪微博腾讯微博开心网豆瓣社区人人网

关键词：RNAmiRNA技参他画远气罗色势养钢新术专题锐博生物丁香通丁香园　点击次数：3447

1、差异表达筛选

通过lnc植客低农乐活变已酸RNA芯片或RNA-seq测序等方法对多对疾病模型和对照样本组织进行ln庆够日十致击齐提cRNA表达谱分身坐聚架露点象思善析。

2、生物信息分析

通过生物信息学的方法筛选出具有表达差异的lncRNA，构建共表达网络，预跟明测lncRNA的靶基因。

3、细胞分子水平研究

（1）功能获得性研试攻吃门干草建究：构建lncRNA过表达载体

（2）功能缺失性研究镇垂：可通过siRNA、shRNA、反义核酸等方法沉默lncRNA，干预lncRNA后检测其对疾病相关基因表达的影响和对细胞表型如增值、凋亡、侵袭、转移等的影响

（3）可通过RNApulldown、RNA-RIP、ChIRP-seq等方法检测与lncRNA结拿阿型名思黄设大缺浓合的DNA、RNA、蛋白质。

4、动物实验

（1）构但毫为建移植瘤或原位瘤模型，转移模型

（2）导入siRNA或者lncRNA表达质粒

（练族围着章都脚企角死3）检测肿瘤生长曲线

（4）通过免疫组化、RT-PCR外李加了演脚宪后复、WesternBlot等方法检测相关指标变化。

小知识

RNA-RIP技术（RNABindingProteinImmunoprecipitation)是一种高通量检测细胞内RNA与蛋白结合情况的技术，运用针对目呀分帝标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来，然后经过分离纯化就可以对结干核验血市与之合在复合物上的RNA进行分析。RIP技术下游结合microarray技术被称为RIP-Chip，帮助我们更高通量地了解癌症以及其它疾病整体水平的RNA变化。

CHIRP-Seq(ChromatinIsolationby减讲RNAPurification)是一种检测与RNA绑定的DNA和蛋白的高通量测序方法。方法是通过设计生物素或链霉亲和素探针，把目标RNA拉下来以后，与其共同作用的上审相武液除八轮与DNA染色体片段就会附在到磁珠上，最后把染色体片段做高通量测序，市语绿试石脸怕这样会得到该RNA能够入宁声余时面新特困丝边结合到在基因组的哪些区域；如果结合物是蛋白质，可以通过将蛋白质打断成短肽再通过质谱进行鉴定，从而或者与RNA结合的蛋白质。RNAPulldown技术与此类似。